驯兽师是玩家进入游戏时需要选择的角色，是玩家在游戏中的“替身”，玩家通过控制驯兽师来对数码宝贝进行管理。除伙伴数码宝贝以外一个驯兽师拥有的数码宝贝总数是9只。伙伴数码宝贝可以在游戏开始时就可以直接进行选择， 其他数码宝贝则需要捕获。

　　玩家在进入游戏后一共有4个驯兽师可以选择：小云，阿天，小娜和佳佳。随着战斗等级的提升，驯兽师的等级也会提升，而且每到一定等级，驯兽师还能获得一定的称号。